Coordinación Nacional: Dirigir las actividades de la Pastoral en todas las instituciones educativas adscritas a la CEMID.
Equipo Administrativo: Encargado de la planeación y manejo administrativo a nivel Nacional.
Equipo de Convivencia: Encargado de la programación, desarrollo y evaluación de las convivencias a nivel nacional.
Sacerdotes: Encargados del área sacramental y desarrollo de la pastoral.
Seminaristas: Encargados de apoyar y animar las actividades de pastoral.
Agentes de Pastoral: Conformados por un docentes en cada institución educativa quien dinamizan la pastoral al interior de la misma.
Equipos locales: Conformados por estudiantes y voluntarios, quienes apoyan las actividades de pastoral en cada institución.
